Le Fairphone 6 prend en charge l'audio via Bluetooth, USB-C et un adaptateur USB-C vers 3,5 mm, mais ne possède pas de prise casque 3,5 mm intégrée. L'audio Bluetooth LE est pris en charge par le Fairphone 5 avec Bluetooth 5.2, il n'y a pas d'information claire pour le Fairphone 6, mais il utilise Bluetooth 5.4, ce qui pourrait en principe permettre l'audio LE. Le firmware Android 15 sur le Fairphone 6 ne prend actuellement pas en charge la fonction de partage audio (Auracast). De plus, le Fairphone 6 ne prend pas en charge le protocole ASHA pour le streaming audio direct vers les processeurs de son cochléaires.