Les batteries des Mini 3 Pro et Mini 4 Pro ne sont pas compatibles avec la Mini 5 Pro. Les batteries Mini 3 fonctionnent avec le Mini 4 Pro, mais pas l'inverse, et le Mini 5 Pro utilise ses propres batteries de vol intelligentes, qui ne sont pas compatibles avec les modèles précédents. De plus, l'utilisation de batteries Mini 4 Pro dans le Mini 5 Pro peut augmenter le poids et faire passer le drone dans une autre catégorie de poids (C1 au lieu de C0).