Vers la fin du XIIIe siècle, l'empire mongol a dévasté des nations entières lors de sa campagne de conquête en Orient. L'île de Tsushima est la seule chose qui sépare encore le continent japonais de l'immense flotte d'invasion des Mongols sous le commandement de l'impitoyable et rusé général Khotun Khan. Lorsque l'île est en flammes après la première vague d'attaques mongoles, le guerrier samouraï Jin Sakai est laissé derrière lui comme l'un des derniers survivants de son clan. Il est déterminé à faire tout ce qui est en son pouvoir pour protéger son peuple à tout prix et reconquérir sa patrie. Il doit rompre avec les traditions qui font de lui un guerrier, prendre une nouvelle voie - la voie de l'esprit - et mener une guerre non conventionnelle pour la liberté de Tsushima.