Le cadre de Pokémon Soleil et Pokémon Lune est la région d'Alola. Elle comprend quatre îles tropicales ainsi qu'une île artificielle. De nombreux Pokémon jamais vus auparavant peuplent les îles luxuriantes d'Alola. L'histoire commence peu après le déménagement du personnage principal à Alola. Une fois que les joueurs ont décidé s'ils veulent jouer en tant que garçon ou fille, ils peuvent choisir leur nom et leur apparence. À peine arrivés, leur aventure commence, au cours de laquelle ils rencontreront de nombreuses personnes fascinantes.

Le Pokédex est un appareil utile qui enregistre des informations sur les Pokémon que le joueur voit et capture au cours de son aventure. Dans Pokémon Soleil et Pokémon Lune, le joueur reçoit un Pokédex très spécial de la part du professeur Kukui, appelé le Rotom-Pokédex. Un Rotom, un Pokémon capable de s'introduire dans des appareils électroniques, y réside. Le Rotom-Pokédex peut faire bien plus que simplement enregistrer des Pokémon - il a sa propre personnalité. Il montre au joueur sur la carte où il se trouve et où il doit aller ensuite. De plus, il lui donne des indices sur le prochain objectif, basés sur les conversations avec d'autres personnages.

Dans Pokémon Soleil et Pokémon Lune, il existe une fonction appelée scanner de QR Code, qui permet aux joueurs d'obtenir des informations sur un Pokémon en scannant le QR Code de ce dernier. Cela leur permet d'enregistrer les Pokémon de la région d'Alola dans leur Pokédex et de découvrir où se trouvent leurs habitats. Lorsque les joueurs scannent le QR Code d'un Pokémon qu'ils n'ont pas encore capturé, ils peuvent ainsi le localiser.