Millenium 3 est programmable non seulement dans le plan de contacts, mais aussi dans le plan fonctionnel et le langage de séquence SFC ou GRAFCET. Dans le plan de contacts, le contrôleur propose des blocs de base généraux (temporisateurs, compteurs, etc.) avec cinq contacts en série et une bobine de sortie. Dans le plan fonctionnel alternatif, les fonctionnalités s'élargissent considérablement (commutateurs à came, régulateurs PID, archives pour la gestion des données, blocs d'alerte). Avec ces possibilités, de nombreuses tâches dans l'industrie, l'artisanat ainsi que dans la formation peuvent être réalisées.