Les nattes japonaises sont un excellent média filtrant. Grâce à leur structure de fibre particulièrement dense, elles garantissent un bon débit d'eau et une grande surface d'implantation pour les bactéries. Les nattes japonaises n'ont pas besoin d'être retirées pour le nettoyage, tant que les grosses impuretés sont interceptées par les brosses filtrantes. Un nettoyage n'est donc pas nécessaire pendant toute la saison. Les nattes sont disposées de manière à permettre un écoulement facile de l'eau, évitant ainsi que le filtre ne se bouche. Sinon, un grand nombre de bactéries filtrantes bénéfiques seraient détruites à chaque nettoyage.